化妆品无尘车间微生物的污染与控制首先要从生产工艺厂房布局入手，净化工程的空气质量，人员管理以及化妆品所需设备和仪器非常重要。化妆品的生产质量与所处环境密切相关。

                   空气的质量环境是化妆品微生物污染重要来源之一，要根据生产工艺和产品质量来控制车间的净化等级。在无尘车间生产环境中，化妆品灌装车间的要按照GMP设计要求来规范。杀菌方式很多，要选择高效实用的杀菌方式，可用药物杀菌，紫外线照射以及过滤除菌等方法。化妆品工厂要远离污染源头，厂房周围环境空气要符合生产要求。车间的建筑结构装饰要有利于清洁和维修，要定期进行维护和保养，以此保持生产操作环境洁净度，厂区的平面布置和设备实施要将原材料保管，生产灌装和包装工序分开，避免灰尘扬起的污染传播。空气的过滤对无尘车间很重要，它主要用于洁净度很高的生产车间的空气净化，要有过滤设备，药物灭菌一般用环氧乙烷和甲醛，同时要注意这两种气体灭菌时的操作规范。紫外线拥有很强的杀菌功能，使用方便，安装简单。化妆品的生产设备和仪器通常用热和化学制剂消毒，热的效果不错，但不适用大规模工业机器使用。因此很多企业使用化学法消毒，消毒前要用热水彻底清洗，保证没有微生物能够产生的温床，防止产品生产时受到污染。灌装机管道等设备要很仔细认真清洗。生产车间的操作人员进入车间前要先用专用洗手液消毒，然后穿上无尘服，戴工作帽以及无尘手套，换上无尘鞋。还要建立个人健康检查制度，经常检查操作人员是否患有皮肤病，手指创伤等，对异常者及时进行调整。